Specjalista inżynierii — bioinformatyka

Avdeling for medisinsk genetikk (MGM) jest jednym z ośmiu jednostek organizacyjnych w Laboratorieklinikken, Haukeland universitetssjukehus. Oddział ma regionalną odpowiedzialność za usługi medyczno-genetyczne w Helse Vest. Zatrudniamy około 95 pracowników o różnym wykształceniu zawodowym, a nasza struktura obejmuje sekcję genetyki klinicznej, jednostkę laboratoryjną z dwiema sekcjami oraz sekcję administracyjną. Regionalne centrum kompetencyjne w zakresie dziedzicznego raka (RKAK) oraz Regionalne centrum medycyny precyzyjnej są również związane z oddziałem. Mamy jasne i przyjemne lokale na 6. piętrze budynku laboratoryjnego, podczas gdy nasza medyczno-genetyczna przychodnia znajduje się na 2. piętrze tego samego budynku.

Nasza działalność charakteryzuje się bliską integracją między kliniką a laboratorium w zakresie diagnostyki, doradztwa i monitorowania pacjentów oraz ich rodzin z potwierdzonymi lub podejrzewanymi stanami dziedzicznymi. Obszar ten szybko się rozwija, oparty na nowej technologii, która umożliwia analizę wszystkich wariantów genetycznych człowieka w jednej próbce. Wraz z rozwojem medycyny spersonalizowanej oczekujemy, że szybko rosnąca wiedza na temat różnorodności materiału genetycznego będzie miała ogromny wpływ na praktykę medyczną w przyszłości. Badania są ważną częścią naszej działalności.

W oddziale dostępna jest stała pozycja (100%) jako specjalista inżynierii w bioinformatyce. Osoba zatrudniona na tym stanowisku weźmie udział w ekscytującym rozwoju zawodowym w zakresie automatyzacji, przetwarzania i analizy danych genomowych oraz innych procesów wsparcia laboratoryjnego w diagnostyce medyczno-genetycznej, ze szczególnym uwzględnieniem sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Specjalista inżynierii będzie odpowiedzialny za rozwój, utrzymanie i zarządzanie niezbędnymi systemami informatycznymi i programami w oddziale, a także za zarządzanie danymi, które są produkowane. Osoba ta będzie częścią dobrego środowiska zawodowego i będzie ściśle współpracować z pracownikami Sekcji bioinformatyki w Laboratoriekliniken.

Obowiązki

• Rozwój i utrzymanie oprogramowania oraz pipeline'ów do analizy danych NGS
• Rozwój i utrzymanie rozwiązań integracyjnych między instrumentami analitycznymi, systemem wsparcia laboratoryjnego i LIMS
• Rozwój i utrzymanie systemu statystyki operacyjnej i kontroli jakości
• Wsparcie użytkowników dla powyższych systemów

Wymagania

• Magister w dziedzinie bioinformatyki, informatyki lub pokrewnej dziedziny. Doświadczenie zawodowe może zrekompensować brak formalnego wykształcenia
• Doświadczenie z narzędziami i pipeline'ami do zarządzania i analizy danych NGS (np. GATK, DeepVariant, Centieon, FastQC, BWA, SAMtools, nextflow)
• Doświadczenie z językami programowania (np. Go, Python, R, javascript), technologiami (np. slurm, git, docker), bazami danych (np. postgresql) i/lub konfiguracją i zarządzaniem systemami operacyjnymi opartymi na Linuxie
• Biegła znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie. Dobra znajomość norweskiego lub innego języka skandynawskiego będzie dodatkowym atutem

Cechy osobiste

• Wysoka kompetencja zawodowa i kreatywność
• Strukturalne podejście, odpowiedzialność i niezawodność
• Orientacja na rozwiązania i obsługę klienta
• Dobre umiejętności komunikacyjne i współpracy w zespole

Oferujemy

• Wynagrodzenie zgodne z obowiązującą umową
• Wysoki poziom zawodowy i dobre możliwości rozwoju zawodowego
• Elastyczne godziny pracy
• Dobre plany emerytalne i ubezpieczeniowe